„Eine biologische Datenbank ist eine große, organisierte Sammlung persistenter Daten, die normalerweise mit computergestützter Software verbunden ist, die dazu dient, Komponenten der im System gespeicherten Daten zu aktualisieren, abzufragen und abzurufen. Eine einfache Datenbank könnte eine einzelne Datei sein, die viele Datensätze enthält, von denen jeder die gleichen Informationen enthält.“
Einige beliebte Datenbanken sind GenBank vom NCBI (National Center for Biotechnology Information), SwissProt vom Schweizerischen Institut für Bioinformatik und PIR von der Protein Information Resource.
GenBank: GenBank (Genetic Sequence Databank) ist einer der am schnellsten wachsenden Speicherorte für bekannte genetische Sequenzen.
EMBL: Die EMBL Nucleotide Sequence Database ist eine umfassende Datenbank mit DNA- und RNA-Sequenzen, die aus der wissenschaftlichen Literatur und Patentanmeldungen stammen und direkt von Forschern und Sequenzierungsgruppen eingereicht werden.
SwissProt: Hierbei handelt es sich um eine Proteinsequenzdatenbank, die ein hohes Maß an Integration mit anderen Datenbanken bietet und außerdem ein sehr geringes Maß an Redundanz aufweist (was bedeutet, dass weniger identische Sequenzen in der Datenbank vorhanden sind).
Verwandte Zeitschriften für Bioinformatik-Datenbanken
Journal of Next Generation Sequencing & Applications, Transcriptomics: Open Access, Drug Design: Open Access, BMC Bioinformatics, Briefings in Bioinformatics, Briefings in Functional Genomics and Proteomics, Comparative and Functional Genomics, International Journal of Data Mining and Bioinformatics, Current Protocols in Bioinformatics, Translational Proteomics, Internet Journal of Genomics and Proteomics, Algorithms for Molecular Biology, Mathematical Biologie und Bioinformatik, BMC Bioinformatik