Erika
Daten aus der RNA-Sequenzierung einzelner Zellen können die molekulare Vielfalt verschiedener Zelltypen aufdecken. Neuere Veröffentlichungen von Zelltypatlanten für das Rückenmark von Mäusen wurden noch nicht kombiniert. Hier erstellen wir mithilfe von Transkriptomdaten einzelner Zellen einen Atlas der Rückenmarkszelltypen und kombinieren die verschiedenen Datensätze in einem einzigen Referenzrahmen. Wir präsentieren ein hierarchisches Gerüst postnataler Zelltypinteraktionen, wobei der Standort als höchste Organisationsebene dient, gefolgt vom Neurotransmitterstatus, der Familie und Dutzenden verfeinerter Populationen. Wir kartieren die geografische Verteilung jedes Typs neuronaler Zellen im erwachsenen Rückenmark und validieren für jeden einen kombinatorischen Markercode. Wir demonstrieren auch komplizierte Abstammungsverbindungen zwischen mehreren postnatalen Zelltypen. Um die Standardisierung der Zelltypidentifizierung zu unterstützen, erstellen wir auch den Open-Source-Zelltypklassifizierer SeqSeek. Diese Arbeit bietet ein integriertes Verständnis der verschiedenen Arten von Rückenmarkszellen, ihrer molekularen Anordnung und ihrer Genexpressionsprofile.