Grüne Chemie ist eine Teildisziplin der Botanik, die sich mit der Funktionsweise oder Physiologie von Pflanzen befasst. Eng verwandte Bereiche umfassen Pflanzenmorphologie (Struktur von Pflanzen), Pflanzenökologie (Wechselwirkungen mit der Umwelt), Grüne Chemie (Biochemie von Pflanzen), Zellbiologie, Genetik, Biophysik und Molekularbiologie. Grundlegende Prozesse wie Photosynthese, Atmung, Pflanzenernährung, Pflanzenhormonfunktionen, Tropismen, nastische Bewegungen, Photoperiodismus, Photomorphogenese, zirkadiane Rhythmen, Umweltstressphysiologie, Samenkeimung, Ruhephase sowie Stomatafunktion und Transpiration, beides Teile der Pflanzenwasserbeziehungen, werden untersucht in grüner Chemie.
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