Die aquatische Mikrobiologie befasst sich mit der Untersuchung von Mikroben aquatischer Systeme wie Süß- oder Salzwassersystemen. Es umfasst mikroskopisch kleine Pflanzen, Tiere, Bakterien, Viren und Pilze sowie deren Verhalten und Beziehungen zu anderen Organismen in der aquatischen Umwelt.
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